Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms