Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms