Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1l1Q6T3U4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1l1Q6T3U4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms