Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms