Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc35e3Q6PGC7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms