Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HjurpQ6PG16 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HjurpQ6PG16 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms