Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms