Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slf2Q6P9P0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms