Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh2Q6P6J4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms