Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casc4Q6P2L7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms