Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm2bQ6P1G2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm2bQ6P1G2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms