Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrimpolQ6P1E7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms