Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf6Q6NVF9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms