Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SphkapQ6NSW3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms