Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt77Q6IFZ6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt77Q6IFZ6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms