Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6GQU0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6GQU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms