Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Carmil1Q6EDY6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms