Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms