Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzrn3Q69ZS0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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