Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp4Q68FH0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms