Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kiaa1549Q68FD9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms