Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CltcQ68FD5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CltcQ68FD5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CltcQ68FD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms