Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno1Q689Z5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
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Sbno1Q689Z5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Sbno1Q689Z5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Sbno1Q689Z5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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Sbno1Q689Z5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Sbno1Q689Z5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Sbno1Q689Z5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno1Q689Z5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno1Q689Z5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno1Q689Z5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno1Q689Z5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno1Q689Z5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno1Q689Z5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno1Q689Z5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno1Q689Z5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno1Q689Z5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms