Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms