Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms