Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VclQ64727 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VclQ64727 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VclQ64727 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VclQ64727 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VclQ64727 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VclQ64727 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VclQ64727 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VclQ64727 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VclQ64727 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VclQ64727 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms