Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh2Q64221 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms