Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms