Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lcn4Q62472 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lcn4Q62472 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lcn4Q62472 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lcn4Q62472 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lcn4Q62472 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Lcn4Q62472 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn4Q62472 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Lcn4Q62472 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lcn4Q62472 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lcn4Q62472 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lcn4Q62472 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lcn4Q62472 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lcn4Q62472 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Lcn4Q62472 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn4Q62472 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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