Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vil1Q62468 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms