Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20854Q62461 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20854Q62461 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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