Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20865Q62460 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20865Q62460 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms