Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tff3Q62395 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tff3Q62395 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tff3Q62395 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tff3Q62395 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff3Q62395 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tff3Q62395 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tff3Q62395 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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