Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrhQ62361 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TrhQ62361 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrhQ62361 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrhQ62361 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrhQ62361 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrhQ62361 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrhQ62361 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms