Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SypQ62277 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SypQ62277 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SypQ62277 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SypQ62277 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SypQ62277 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SypQ62277 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SypQ62277 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SypQ62277 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SypQ62277 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SypQ62277 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms