Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Ttf1Q62187 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Ttf1Q62187 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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Ttf1Q62187 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Ttf1Q62187 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Ttf1Q62187 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Ttf1Q62187 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Ttf1Q62187 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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Ttf1Q62187 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Ttf1Q62187 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ttf1Q62187 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ttf1Q62187 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms