Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SspnQ62147 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SspnQ62147 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms