Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms