Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms