Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp2Q61990 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp2Q61990 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp2Q61990 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp2Q61990 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp2Q61990 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp2Q61990 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pcbp2Q61990 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcbp2Q61990 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms