Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms