Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx5Q61686 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx5Q61686 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx5Q61686 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx5Q61686 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx5Q61686 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx5Q61686 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx5Q61686 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx5Q61686 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms