Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde3bQ61409 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde3bQ61409 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms