Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms