Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1bQ61271 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1bQ61271 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms