Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms