Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf9Q61179 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms