Protein–RNA interactions for Protein: Q61139

Pcsk7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk7Q61139 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Pcsk7Q61139 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Pcsk7Q61139 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Pcsk7Q61139 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Pcsk7Q61139 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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Pcsk7Q61139 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Pcsk7Q61139 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Pcsk7Q61139 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk7Q61139 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Pcsk7Q61139 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Pcsk7Q61139 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Pcsk7Q61139 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk7Q61139 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms