Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nab1Q61122 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nab1Q61122 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms