Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf1Q61069 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf1Q61069 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf1Q61069 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf1Q61069 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf1Q61069 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf1Q61069 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf1Q61069 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usf1Q61069 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usf1Q61069 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf1Q61069 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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